3 conseils centraux : le Conseil d'administration, le Conseil des études et de la vie universitaire et le Conseil scientifique déterminent la politique de l'université.

Le conseil d'administration (CA)

Son rôle est de déterminer la politique de l'établissement, de se prononcer sur toutes les questions engageant la politique générale de l'université (répartition des emplois, habilitation des diplômes...), le plus souvent sur proposition du Conseil des études et de la vie universitaire et du Conseil scientifique et enfin de voter le budget et d'approuver les comptes.
Le budget prévisionnel est voté en décembre et les comptes financiers qui retracent la réalité des opérations financières accomplies sont approuvés en mai/juin.

Le conseil des études et de la vie universitaire (CEVU)

Sa compétence touche toutes les questions quant à l'organisation des études, sur un plan à la fois pédagogique et administratif, dans le domaine de la formation initiale comme dans celui de la formation continue.

Le CEVU travaille sur l'offre de formations de l'université :

• en examinant les demandes de création et de transformation de diplômes et les contenus de leurs enseignements
• en fixant les règles du contrôle des connaissances
• en mettant en place des régimes d'études spécifiques, pour les étudiants élus dans les conseils par exemple.

Ce conseil s'occupe également de la vie étudiante au sens large du terme : accueil en première année, activités culturelles et sportives, vie du campus, associations...

Le conseil scientifique (CS)

Son rôle est de déterminer la politique de recherche de l'Université et les crédits correspondants, dans le cadre des équipes constituées, et de se prononcer sur le recrutement et la qualification des enseignants-chercheurs.